4042年，人类成功制造出了超大型粒子加速器，并且从理论上重新证明了爱因斯坦的狭义相对论，通过加速器将物体加速，直至超越光速，产生强大的引力场，激发出罗森桥，即时空隧道，并用反物质稳定器阻止潮汐力撕裂罗森桥。4043年6月，D国完成了第一次人类时空穿梭，将其命名为祖父计划。然而实验突发意外，人类的祖先，始祖智猿安卡意外死亡，人类面临着文明倒退的严重危机。
在联合国的紧急会议上，祖父计划的总负责人安德正解释着目前的情况：始祖智猿已死，再一次诞生新的智猿需要150年。也就是说，人类面临着文明倒退150年的情况，至于其他的影响，目前还不得而知话未说完，便被M国总统不耐烦地打断：都怪你们愚蠢的实验，整个人类文明都被你们毁了！气氛一时剑拔弩张起来。安德无法反驳，只能接着说：然而还有机会。智猿的死亡就像往平静的湖面扔了颗石头。时间的倒退是由智猿时期开始，像波纹一样向外扩散的，我们称之为‘潮’，潮到达我们所在的时间维度，需要三个月的时间。只要在三个月内阻止安卡的死亡，我们就能修正错误，消灭‘潮’。
气氛缓和下来，各国领导人最终达成了协议，同意共同支援D国重启加速器，前往更久以前的时空，阻止安卡的死亡。
加速器的运行需要巨量电力，仅仅靠D国的发电量，即使全国停电，也需要3个月才能完成充能。D国周边的国家动用军方的力量封锁了高速，运输电缆的军用卡车如同钢铁洪流，呼啸着向D国赶去。
最终，加速器只用了一个月就完成了充能，人们看到了希望。
潮的迹象开始浮现，有着数千年的D国文明已经开始倒退，各类高级建筑已经化为粒子态，渐渐湮灭。人们不敢怠慢，立马开始准备加速器的启动。‘潮’向着加速器袭来，来不及逃走的人们被‘潮’吞噬，而后消逝。
嗡——加速器响起巨大的轰鸣声，球形座舱开始在轨道上旋转，速度越来越快。加速器达到预计速度，完成了传输，随后就被‘潮’所吞噬，只留下一片光秃秃的土地。
最终，穿越者找到了智猿安卡的死因——一代传送舱启动时的噪音将一只剑齿虎吸引了过来，并将安卡杀死。穿越者用电击器击晕了剑齿虎，救下了安卡。
人类的危机终于解除，祖父计划也被联合国接任，设立专门机构进行管理和限制，对时空穿梭技术进行封存管理。
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